リーファーコンテナは、内蔵の冷凍ユニットにより-30℃から+30℃までの温度帯を維持できる特殊コンテナである。青果物・水産物・食肉などの生鮮品のほか、近年は医薬品のコールドチェーン輸送やワインの定温輸送にも需要が拡大している。ドライコンテナと比較してフレートは20〜50%程度の割増となるのが一般的で、港湾やCYでは外部電源（リーファープラグ）の接続が必要だ。本船上でも専用電源設備が求められるため、1隻あたりの搭載可能本数に制限がある。CA（Controlled Atmosphere）機能付きの上位モデルでは酸素・二酸化炭素の濃度調整も可能で、長距離輸送での鮮度維持に貢献する。